Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps3P62908 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps3P62908 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms