Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnb1P62874 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms