Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElobP62869 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ElobP62869 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ElobP62869 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ElobP62869 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ElobP62869 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ElobP62869 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms