Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl23aP62751 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl23aP62751 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms