Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hpcal1P62748 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hpcal1P62748 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms