Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms