Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf3P61205 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf3P61205 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms