Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fgf1P61148 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fgf1P61148 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms