Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Snap25P60879 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snap25P60879 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms