Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CirbpP60824 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CirbpP60824 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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