Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf3b6P59708 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b6P59708 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms