Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nphp4P59240 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms