Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Scarf2P59222 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scarf2P59222 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scarf2P59222 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scarf2P59222 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scarf2P59222 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scarf2P59222 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scarf2P59222 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms