Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rab4aP56371 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab4aP56371 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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