Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pex2P55098 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms