Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aqp4P55088 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aqp4P55088 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms