Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Faf1P54731 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms