Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RabggtbP53612 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RabggtbP53612 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RabggtbP53612 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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