Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2e3P52483 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2e3P52483 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms