Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr4P51680 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr4P51680 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms