Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpcP51612 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpcP51612 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XpcP51612 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XpcP51612 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XpcP51612 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XpcP51612 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XpcP51612 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XpcP51612 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XpcP51612 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XpcP51612 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XpcP51612 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XpcP51612 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XpcP51612 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XpcP51612 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XpcP51612 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XpcP51612 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XpcP51612 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XpcP51612 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XpcP51612 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XpcP51612 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XpcP51612 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms