Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RorcP51450 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RorcP51450 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RorcP51450 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RorcP51450 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorcP51450 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorcP51450 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorcP51450 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorcP51450 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorcP51450 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms