Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc13P50207 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc13P50207 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms