Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cav1P49817 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cav1P49817 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms