Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PtpreP49446 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtpreP49446 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PtpreP49446 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpreP49446 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtpreP49446 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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