Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Edn3P48299 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms