Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl5P47962 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl5P47962 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl5P47962 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms