Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab11bP46638 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms