Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hmx2P43687 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hmx2P43687 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms