Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlx1P43345 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tlx1P43345 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms