Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hmx3P42581 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx3P42581 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms