Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtbP41155 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LtbP41155 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtbP41155 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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LtbP41155 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LtbP41155 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbP41155 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LtbP41155 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbP41155 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbP41155 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtbP41155 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LtbP41155 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbP41155 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LtbP41155 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbP41155 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LtbP41155 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbP41155 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbP41155 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbP41155 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbP41155 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtbP41155 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LtbP41155 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LtbP41155 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms