Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col18a1P39061 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col18a1P39061 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col18a1P39061 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms