Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpargP37238 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PpargP37238 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpargP37238 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpargP37238 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpargP37238 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpargP37238 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PpargP37238 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpargP37238 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpargP37238 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 647.5 ms