Protein–RNA interactions for Protein: P36368

Egfbp2, Epidermal growth factor-binding protein type B, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egfbp2P36368 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Egfbp2P36368 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Egfbp2P36368 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Egfbp2P36368 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Egfbp2P36368 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Egfbp2P36368 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Egfbp2P36368 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Egfbp2P36368 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Egfbp2P36368 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms