Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddit3P35639 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms