Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ly6dP35459 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms