Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin1P35438 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin1P35438 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin1P35438 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms