Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab17P35292 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab17P35292 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms