Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa3P35173 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa3P35173 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms