Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp4P35123 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp4P35123 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp4P35123 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp4P35123 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms