Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tfap2aP34056 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tfap2aP34056 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms