Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd1P33215 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms