Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Saa4P31532 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Saa4P31532 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms