Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gsx1P31315 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsx1P31315 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx1P31315 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms