Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa11P31311 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms