Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VtnP29788 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VtnP29788 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms