Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GrnP28798 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GrnP28798 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GrnP28798 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GrnP28798 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GrnP28798 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GrnP28798 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GrnP28798 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms