Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RxrgP28705 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RxrgP28705 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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