Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BgnP28653 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BgnP28653 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BgnP28653 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BgnP28653 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BgnP28653 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
BgnP28653 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BgnP28653 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BgnP28653 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BgnP28653 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BgnP28653 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms